Jonathan Becker studierte Klavier und Dirigieren in Frankfurt am Main. Bereits während des Studiums führten ihn Engagements als Dirigent an die Kammeroper Frankfurt und die junge Oper Rhein-Main. Neben der Arbeit als Dirigent sang er in verschiedenen Kammerchören, wie dem Stuttgarter Kammerchor, dem Tenso Europe Chamber-Choir oder dem Vokalensemble Rastatt. Nach dem Studium führte ihn 2017 seine erste Stelle als Assistent des Chordirektors nach Mannheim. Seit 2021 arbeitet er als Stellvertretender Chordirektor an der Semperoper Dresden. Außerdem konzertiert Jonathan Becker regelmäßig als Liedbegleiter. So spielte er bereits bei Chor@Berlin zusammen mit dem Deutschen Jugendkammerchor unter Leitung von Frieder Bernius, bei den Fränkischen Musiktagen, den Bad-Hersfelder Festpielen und vielen weiteren Festivals.